El cambio climático está presente en los mares, las zonas costeras y los cuerpos intercontinentales de México, existen evidencias del calentamiento, de la modificación del nivel del mar y del efecto de la acidificación sobre los arrecifes.

En la actualidad, se está dando seguimiento a otros organismos con carbonatos, como los equinodermos, para evaluar los efectos del fenómeno.

Además, en los mares del país se cuenta con ejemplos recientes de eutroficación (o eutrofización), proceso que, por causas naturales o antropogénicas, enriquece las aguas con nutrientes (principalmente nitratos y fosfatos), lo que provoca el aumento de algas y fitoplancton, la pérdida de transparencia del líquido, lo que disminuye la fotosíntesis por falta de luz y el aumento de la descomposición de la materia orgánica, que reduce la concentración de oxígeno en el agua.

También hay ejemplos de hipoxias, o falta de oxígeno, en zonas costeras nacionales, por lo que se debe promover más la investigación sobre estos temas de forma interdisciplinaria, para tener cada día mejor información y herramientas que favorezcan la toma de decisiones.

Existe una conectividad en los ecosistemas, una interrelación que no se puede dejar de lado. Es un asunto de gran complejidad y aún no es posible saber si el incremento del nivel del mar es consecuencia del cambio climático o de la manipulación de las aguas interiores, que se descargan a la zona costera. Para evaluar la vulnerabilidad de ecosistemas costeros, se deben considerar factores naturales y antropogénicos que ya participan en su dinámica y deterioro, pues sólo así será posible delimitar los efectos adicionales.

El 85 por ciento de las pesquerías del Pacífico están en deterioro o máximo aprovechamiento sustentable; lo mismo ocurre con el 19 por ciento de las del Golfo de México.

Se debe tener en cuenta que el cambio climático aumentará la vulnerabilidad de los sistemas acuáticos y las pesquerías. Se ha calculado que con un incremento del nivel del mar de 50 centímetros, éste entraría a tierra hasta 23 mil kilómetros. Ello implica la pérdida de lagunas costeras hasta en 50 por ciento.

La zona económica exclusiva del país tiene tres millones de kilómetros, y dentro de ésta se ubica la plataforma continental, con aproximadamente 360 mil kilómetros. Aquí se lleva a cabo toda la pesca en México, con excepción de algunas pesquerías, como la de atún, que se realiza en aguas oceánicas y tiene graves problemas de contaminación y vulnerabilidad, lo cual sin duda aumentará a causa del cambio climático.